Если уши действительно чистые - как раз не надо чистить. Иногда есть смысл смазывать уши изнутри маслянистым таким лосьоном для ухода за ушами (НЕ лечебным, уходовым, лучше брать импортные варианты).
Чтобы уши не чесались.

Если совсем такая заметная почесуха продолжится, надо будет снова связываться с доктором - это же может быть симптом типа аллергического, или что-нибудь еще.
А вообще 1-2 раза в день кот имеет право почесать ушко :) без ажиотажа. Мы же тоже иногда чешем.